在南京注冊分公司的步驟如下： 一、準備材料
1. 公司營業執照副本；

2. 法定代表人身份證明；

3. 公司章程；

4. 公司經營許可證；

5. 公司組織機構代碼證；

6. 稅務登記證；

7. 企業法人營業執照；

8. 銀行開戶許可證。
二、申請流程
1. 首先，在南京市工商行政管理局進行分公司注冊申請，并提供上述材料；

2. 申請人應當向工商行政管理局提交《關于分公司注冊申請書》，并附上相關材料；

3. 工商行政管理局將對申請書進行審核，并出具《分公司注冊審批通知書》；

4. 根據《分公司注冊審批通知書》的要求，申請人應當向工商行政管理局提交《分公司注冊申請書》、《分公司章程》、《分公司財務報告》、《分公司資金使用情況聲明書》、《分公司法定代表人委任書》、《分公司法定代表人身份證明》、《分公司法定代表人保證書》、《分公司法定代表人授權委托書》、《分公司法定代表人授權委托書附件》、《分公司法定代表人授權委托書附件2》、《分公司法定代表人授權委托書附件3》、《分公司法定代表人授權委托書附件4》、《分公司法定代表人授權委托書附件5》、《分公司法定代表人授權委托書附件6》。

5. 工商行政管理局將對上述材料進行審核，并出具相應的審批意見。
如無異議，將出具正式的“南京市工商行政管理局XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXX(XX)XXXXX”。

6. 最后，申請人應當向國家稅務總局申請“南京市工商行政管理局XXXXX”的復印件。